Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPSAP08865 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPSAP08865 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPSAP08865 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPSAP08865 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPSAP08865 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPSAP08865 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPSAP08865 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPSAP08865 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPSAP08865 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPSAP08865 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPSAP08865 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPSAP08865 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPSAP08865 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPSAP08865 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPSAP08865 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPSAP08865 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms