Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CLIP1-209ENST00000537178 5229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 DEF8-227ENST00000570182 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 COL4A6-202ENST00000372216 6570 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GCNT3-201ENST00000396065 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SMARCAL1-201ENST00000357276 3271 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AL360004.1-201ENST00000358748 3258 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC16B-201ENST00000308284 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PUS7-201ENST00000356362 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNB2-204ENST00000377315 3461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 OTUB2-201ENST00000203664 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FLII-222ENST00000579294 3936 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZDHHC9-201ENST00000357166 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PLXNB2-213ENST00000610984 3443 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SP100-201ENST00000264052 3882 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPC2-201ENST00000451043 3173 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SMC1B-202ENST00000404354 3636 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 LACC1-201ENST00000325686 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHGC3-201ENST00000308177 4725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 DENND5B-203ENST00000536562 4291 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF286B-201ENST00000285274 5145 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FRY-202ENST00000380250 10688 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FRY-209ENST00000642040 10697 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 USP11-201ENST00000218348 3338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AF254983.1-201ENST00000612267 3336 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PIP4K2C-203ENST00000540759 2876 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 GPHN-201ENST00000315266 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012377.1-202ENST00000558675 4811 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 HEATR6-203ENST00000585976 3288 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 MAP3K14-202ENST00000376926 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP40-202ENST00000373345 2841 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SWT1-202ENST00000367501 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 C2CD2-201ENST00000329623 5844 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFAT-207ENST00000520214 4294 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 NTRK2-204ENST00000359847 6646 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 PIWIL2-201ENST00000356766 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC12A4-209ENST00000572037 3620 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 AC132825.4-201ENST00000582527 3644 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 FP565260.7-201ENST00000623998 3634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 IGFL3-201ENST00000341415 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 TRBV5-6-201ENST00000390375 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD88A-201ENST00000408314 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.3 ms