Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL512638.3-201ENST00000620370 298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121955.1-201ENST00000620852 303 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073255.1-201ENST00000624149 177 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010507.2-201ENST00000632795 676 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYT1L-204ENST00000428368 4850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 HAP1-202ENST00000341193 3880 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 HLTF-202ENST00000392912 3896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PBRM1-205ENST00000409057 4980 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMA3-AS1-214ENST00000557660 2360 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF26-207ENST00000619748 2933 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 L3MBTL4-202ENST00000400104 4534 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 FCRL4-201ENST00000271532 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00461-212ENST00000511014 3539 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMMECR1L-202ENST00000393001 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ESYT1-201ENST00000267113 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACAN-201ENST00000352105 7526 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF3-202ENST00000338458 3639 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF816-206ENST00000444460 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 JADE1-214ENST00000611140 5648 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 FHOD3-202ENST00000359247 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLG3-210ENST00000542398 4529 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 HBS1L-204ENST00000367826 2703 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM196-201ENST00000405764 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLGA6L22-203ENST00000620691 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011199.1-201ENST00000625022 3362 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CALCOCO1-201ENST00000262059 5866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNJ15-207ENST00000398934 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01940-201ENST00000455228 3489 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUSP3-201ENST00000226004 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF512-204ENST00000416005 3515 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPB41L2-232ENST00000628542 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 NAALAD2-210ENST00000534061 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP005058.1-201ENST00000580193 2975 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCK1-201ENST00000319441 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM71F2-205ENST00000641605 5749 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATG9A-202ENST00000396761 3799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUCY1B3-201ENST00000264424 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPGRIP1-213ENST00000557771 3870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAZ2A-211ENST00000549884 6050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEK1-206ENST00000510533 5377 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCEH1-204ENST00000475381 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF24-202ENST00000402558 6131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SVIL-201ENST00000355867 7586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 EARS2-201ENST00000449606 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH1-214ENST00000621016 3304 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPIP5K1-203ENST00000360135 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPIP5K1-204ENST00000360301 5565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 NTPCR-202ENST00000366628 6311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 NSD2-212ENST00000503128 8568 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CFAP44-201ENST00000295868 3377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PART1-201ENST00000504876 5616 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000446.1-201ENST00000530045 2643 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZAN-205ENST00000613979 8669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERICH3-201ENST00000326665 7159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LEP-201ENST00000308868 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02028-202ENST00000432154 2666 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA0895-202ENST00000317020 4241 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 THSD7B-203ENST00000413152 5846 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LACC1-203ENST00000441843 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASSF6-203ENST00000342081 4331 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms