Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPS28Q9Y2Q9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms