Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SWAP70Q9UH65 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms