Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms