Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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