Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH6

TMLHE, Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHEQ9NVH6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMLHEQ9NVH6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMLHEQ9NVH6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms