Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 PLSCR2-205ENST00000497985 1441 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC104123.1-203ENST00000513158 575 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 LINC02509-201ENST00000508790 691 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 TMEM92-AS1-201ENST00000508851 750 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms