Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER1Q9C0I3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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