Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BCO2Q9BYV7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms