Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POP1Q99575 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POP1Q99575 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POP1Q99575 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POP1Q99575 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POP1Q99575 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POP1Q99575 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POP1Q99575 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POP1Q99575 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POP1Q99575 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POP1Q99575 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POP1Q99575 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms