Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD4LQ96PU5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms