Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF354BQ96LW1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms