Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMIM12Q96EX1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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