Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CMTM5Q96DZ9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM5Q96DZ9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms