Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DNAJA4Q8WW22 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNAJA4Q8WW22 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DNAJA4Q8WW22 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DNAJA4Q8WW22 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms