Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF554Q86TJ5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms