Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN1Q6NZI2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms