Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q1T7F1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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