Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KNOP1Q1ED39 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KNOP1Q1ED39 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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