Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UPP1Q16831 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UPP1Q16831 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms