Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-216ENST00000484280 891 ntTSL 511.9□□□□□ -0.55e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 AL603832.3-204ENST00000605933 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.37□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 AL603832.3-202ENST00000607158 807 ntTSL 511.37□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 AL603832.3-201ENST00000471038 792 ntTSL 210.58□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-214ENST00000478447 420 ntTSL 210.4□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-211ENST00000436685 517 ntTSL 59.18□□□□□ -0.945e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 ATP13A1-212ENST00000496082 698 ntTSL 411.91□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 HNRNPU-213ENST00000638301 3650 ntTSL 57.03□□□□□ -1.287e-14■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC13.84□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RPS6KA4-205ENST00000530504 2114 ntTSL 519.87■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RPS6KA4-203ENST00000528355 2532 ntTSL 217.58■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.353e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 BRD1-204ENST00000438393 3051 ntTSL 213.58□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 COQ8B-209ENST00000595254 867 ntTSL 513.51□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.448e-8■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RNPEPL1-207ENST00000481757 3944 ntTSL 212.05□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 CEP85-206ENST00000476272 3507 ntTSL 29.45□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 SFXN5-209ENST00000464825 532 ntTSL 48.19□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.178e-8■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 CYB5R1-203ENST00000473599 661 ntTSL 315.01□□□□□ -0.013e-7■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 ZNF316-202ENST00000427912 520 ntTSL 313.75□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.791e-6■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 MFSD12-208ENST00000588918 2040 ntTSL 525.74■■□□□ 1.711e-6■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.71e-6■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 MFSD12-214ENST00000615073 986 ntTSL 320■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 MFSD12-209ENST00000589063 590 ntTSL 318.76■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 MFSD12-211ENST00000589995 777 ntTSL 317.6■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.312e-8■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.112e-8■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 MAP4K2-212ENST00000489952 1468 ntTSL 523.11■■□□□ 1.296e-8■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 MAP4K2-208ENST00000467689 574 ntTSL 510.21□□□□□ -0.776e-8■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 CHMP2A-201ENST00000312547 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 CHMP2A-206ENST00000600118 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 CHMP2A-205ENST00000600006 766 ntTSL 27.58□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 AP002990.1-201ENST00000526409 1954 ntTSL 517.76■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 EEF1G-203ENST00000525340 2496 ntTSL 1 (best)16.12■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 EEF1G-204ENST00000532986 578 ntTSL 410.88□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 35.7
EFTUD2Q15029 HNRNPA1-208ENST00000548688 711 ntTSL 37.28□□□□□ -1.246e-13■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.423e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 UBA52-207ENST00000596273 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 UBA52-201ENST00000430157 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 UBA52-205ENST00000595683 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 RACK1-209ENST00000504128 990 ntTSL 27.93□□□□□ -1.145e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 PRPF19-205ENST00000540473 169 ntTSL 56.16□□□□□ -1.421e-11■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.53e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 CC2D1B-204ENST00000450942 2018 ntTSL 516.07■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 CC2D1B-203ENST00000438021 2521 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 CC2D1B-205ENST00000460261 2640 ntTSL 1 (best)13.77□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 CLPTM1-208ENST00000588274 805 ntTSL 212.69□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 CLPTM1-211ENST00000589347 638 ntTSL 39.98□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 LYPLA2-207ENST00000421070 429 ntTSL 515.37■□□□□ 0.056e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 RAB26-204ENST00000562735 1720 ntTSL 527.27■■□□□ 1.962e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.912e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.353e-32■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 RAB26-205ENST00000564426 1922 ntTSL 1 (best)20.55■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 RAB26-206ENST00000565592 857 ntTSL 1 (best)18.84■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 RAB26-203ENST00000561600 699 ntTSL 218.75■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 RAB26-208ENST00000567145 609 ntTSL 517.84■□□□□ 0.452e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 NDUFV1-208ENST00000526770 1748 ntTSL 519.05■□□□□ 0.645e-8■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 NDUFV1-207ENST00000526169 774 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.615e-8■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 NDUFV1-210ENST00000527923 594 ntTSL 217.78■□□□□ 0.445e-8■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 FKBP4-206ENST00000543769 425 ntTSL 514.22□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 NDUFV1-226ENST00000533919 774 ntTSL 313.26□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 NDUFV1-209ENST00000527355 679 ntTSL 213.26□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 POLR3E-207ENST00000563766 2061 ntTSL 220.76■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 POLR3E-210ENST00000564256 449 ntTSL 311.62□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 GNL3-207ENST00000474423 567 ntTSL 313.19□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 EDC4-203ENST00000572031 584 ntTSL 311.79□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 TOMM40-206ENST00000592041 707 ntTSL 214.98□□□□□ -0.015e-10■■■■■ 35.6
EFTUD2Q15029 PCBP2-224ENST00000552980 527 ntTSL 32.73□□□□□ -1.971e-15■■■■■ 35.5
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 1672.8 ms