Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COL9A2Q14055 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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