Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SKP2Q13309 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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