Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CALCOCO2Q13137 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CALCOCO2Q13137 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CALCOCO2Q13137 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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