Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SLFN5Q08AF3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLFN5Q08AF3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms