Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLC3A1Q07837 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms