Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCDQ05655 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRKCDQ05655 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms