Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms