Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A2Q01362 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms