Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HBBP68871 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
HBBP68871 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
HBBP68871 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms