Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERFP50548 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERFP50548 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERFP50548 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERFP50548 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms