Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRPC1P48995 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRPC1P48995 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms