Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CASQ1P31415 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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