Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSMB9P28065 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PSMB9P28065 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms