Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF3P18847 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF3P18847 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF3P18847 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF3P18847 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF3P18847 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF3P18847 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF3P18847 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms