Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMIGD3P0DMS9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms