Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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TSPAN13O95857 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TSPAN13O95857 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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