Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CRXO43186 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CRXO43186 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRXO43186 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRXO43186 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRXO43186 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CRXO43186 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CRXO43186 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CRXO43186 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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