Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353597.3-201ENST00000624365 3745 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EFHC1-201ENST00000371068 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GLE1-202ENST00000372770 2218 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ACAN-206ENST00000559004 7628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIP5K1-207ENST00000396923 5636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF135-203ENST00000401053 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF185-202ENST00000326132 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TYW1-207ENST00000615572 3156 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP4R1L-202ENST00000334187 2746 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF21A-201ENST00000323180 3675 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HPS1-204ENST00000361490 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SMPD4P1-201ENST00000416717 2263 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004893.2-201ENST00000360902 3398 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-201ENST00000314915 4340 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00898-201ENST00000380990 4185 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL1-203ENST00000602748 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37A11P-201ENST00000425901 3580 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PKD1L2-210ENST00000533478 5669 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SRGAP2-217ENST00000624873 4705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF2-215ENST00000636488 3908 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00930-202ENST00000557075 1541 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJA4-201ENST00000343789 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TYW1-201ENST00000359626 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM193A-210ENST00000545951 3987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ELP3-210ENST00000521015 3158 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EFHC1-213ENST00000635996 2548 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IL17REL-202ENST00000389983 3668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP27-212ENST00000532038 3694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC24A3-202ENST00000613834 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KANK4-203ENST00000371150 3023 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC30A-201ENST00000355689 5975 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAND5-201ENST00000237937 5310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DEF8-227ENST00000570182 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL008628.1-201ENST00000564198 5187 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PAX6-245ENST00000638914 7300 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EXOC7-205ENST00000405575 2208 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CMC1-205ENST00000466830 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.1 ms