Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms