Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POMPQ9Y244 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms