Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NMES1Q9C002 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NMES1Q9C002 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms