Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GABARAPL3Q9BY60 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms