Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CR12Q96Q35 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CR12Q96Q35 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms