Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FGD4Q96M96 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms