Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUB1Q96FW1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUB1Q96FW1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUB1Q96FW1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUB1Q96FW1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OTUB1Q96FW1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTUB1Q96FW1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms