Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PRG4Q92954 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRG4Q92954 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRG4Q92954 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRG4Q92954 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRG4Q92954 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRG4Q92954 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms