Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMK4

VASN, Vasorin, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASNQ6EMK4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VASNQ6EMK4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VASNQ6EMK4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
VASNQ6EMK4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VASNQ6EMK4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VASNQ6EMK4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VASNQ6EMK4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VASNQ6EMK4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VASNQ6EMK4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VASNQ6EMK4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VASNQ6EMK4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VASNQ6EMK4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VASNQ6EMK4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms